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3月10日,2025 ASC世界大学生超级计算机竞赛(ASC25)公布了预赛成绩和决赛入围名单。 依托南京大学eScience中心与信息化中心的联合支持,在信息化中心副主任姚舸老师的全程指导下 ,南京大学队在全球300多支预赛参赛队伍中脱颖而出,首次成功晋级,实现了历史性突破。
接下来,团队将在5月10日-14日于青海大学举行的总决赛中,向冠亚军、超级团队奖、e Prize计算挑战奖、最高计算性能奖等重要奖项发起冲击。
南京大学参赛队员:
朱江云 21级物理学院
彭枳驭 21级物理学院
宁锐 22
级软件学院
茆弘之 22级计算机学院
杨承岳 23级软件学院
指导老师:
姚舸 信息化中心副主任
本次ASC25预赛中,参赛者面对两大挑战:RNA甲基化修饰位点检测和AlphaFold3推理优化。
RNA甲基化修饰位点检测 重点在于优化mRNA上“5-甲基胞嘧啶”(m5C)修饰位点的检测流程。参赛团队的任务不仅限于梳理操作步骤和构建软件环境,还需处理总计约3.4亿条测序数据的三个数据集。在确保结果准确无误的前提下,追求极致的性能优化,以期在海量数据处理中以效率制胜。
AlphaFold3推理优化 则聚焦于结构预测代码的优化工作。参赛者需将原本运行在GPU平台上的AlphaFold3代码移植到CPU平台上,并确保其高效运行。任务要求在保持预测精度不变的情况下,对组委会指定的12组蛋白质序列进行快速推理。这不仅是对编程技巧的考验,更是对计算资源利用效率的挑战。
这两个赛题融合了高性能计算与人工智能,要求参赛团队充分结合软硬件环境,通过深入挖掘平台潜力,最大化计算性能,为解决复杂科学问题提供强有力的支持。
(图片、资料来源:公众号“ASC超算”)